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[Altri] Un riassunto di 20 strumenti classici di biologia online

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Pubblicato su 06/12/2018 08:28:12 | | |
Scansione del promotore
Funzione: Previsione del promotore
Sito web:https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/



Cercatore ORF
Funzione: Previsione ORF
Sito web:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/



NCBI-BLAST
Funzione: Allineamento delle sequenze
Sito web:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi



MUSCOLI
Funzione: Allineamento multi-sequenza con velocità di corsa relativamente elevata
Sito web:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#



Clustal Omega
Funzione: Allineamento multi-sequenza di DNA, RNA e proteine
Sito web:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/



ClustalW2
Funzione: Allineamento multi-sequenza ampiamente utilizzato
Sito web:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/



T-Coffee
Funzione: Alta precisione, allineamento multi-sequenza lento
Sito web:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/



SimiTriX-SimiTetra
Funzione: Visualizzazione della similarità di allineamento multi-sequenza
Sito web:http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php



Venn Picture
Funzione: Disegnare diagrammi di Venn
Sito web:http://www.biovenn.nl/index.php



Venn Picture
Funzione: Disegnare diagrammi di Venn
Sito web:http://bioinformatics.psb.ugent.... calculate_venn.htpl



Venn Picture
Funzione: Disegnare diagrammi di Venn
Sito web:http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html



WEGO
Funzione: Disegna il grafico dei risultati delle annotazioni GO
Sito web:http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl



CIRCOS
Funzione: Disegnare diagrammi a cerchio
Sito web:http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/



CIRCexplorer
Funzione: Eseguire analisi circRNA
Sito web:http://circexplorer2.readthedocs.io/en/latest/



iPath
Funzione: Eseguire l'analisi online delle mappe visive dei percorsi
Sito web:http://pathways.embl.de/



KEGG
Funzione: Annotare le vie metaboliche dei geni
Sito web:http://www.kegg.jp/blastkoala/



UCSC
Funzione: Visualizzazione del genoma
Sito web:http://genome.ucsc.edu/index.html



IBS
Funzione: Disegnare uno schema della struttura della sequenza
Sito web:http://ibs.biocuckoo.org/online.php



RAP
Funzione: Analisi online dell'RNA-seq
Sito web:https://bioinformatics.cineca.it/rap/



AUGUSTUS
Funzione: Introne di esoni genici, UTR, annotazione
Sito web:http://bioinf.uni-greifswald.de/webaugustus/prediction/create



GSDS
Funzione: Esone genico intron, UTR, dominio e altre caratteristiche regionali visualizzate
Sito web:http://gsds.cbi.pku.edu.cn/





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