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[Autre] Un résumé de 20 outils classiques de biologie en ligne

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Publié sur 06/12/2018 08:28:12 | | |
Scan du promoteur
Fonction : Prédiction du promoteur
Site internet:https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/



Détecteur ORF
Fonction : Prédiction ORF
Site internet:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/



NCBI-BLAST
Fonction : Alignement des séquences
Site internet:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi



MUSCLE
Fonction : Alignement multi-séquence avec une vitesse de course relativement élevée
Site internet:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#



Clustal Omega
Fonction : Alignement multi-séquence de l’ADN, de l’ARN et des protéines
Site internet:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/



ClustalW2
Fonction : Alignement multi-séquences largement utilisé
Site internet:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/



T-Coffee
Fonction : Haute précision, alignement lent à plusieurs séquences
Site internet:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/



SimiTriX-SimiTetra
Fonction : Affichage de similarité d’alignement multi-séquence
Site internet:http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php



Venn Picture
Fonction : Dessiner des diagrammes de Venn
Site internet:http://www.biovenn.nl/index.php



Venn Picture
Fonction : Dessiner des diagrammes de Venn
Site internet:http://bioinformatics.psb.ugent.... calculate_venn.htpl



Venn Picture
Fonction : Dessiner des diagrammes de Venn
Site internet:http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html



WEGO
Fonction : Graphique de résultats d’annotation GO dessiné
Site internet:http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl



CIRCOS
Fonction : Dessiner des diagrammes circulaires
Site internet:http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/



CIRCexplorer
Fonction : Effectuer une analyse des circARN
Site internet:http://circexplorer2.readthedocs.io/en/latest/



iPath
Fonction : Effectuer une analyse en ligne de cartes visuelles des voies
Site internet:http://pathways.embl.de/



KEGG
Fonction : Annoter les voies métaboliques des gènes
Site internet:http://www.kegg.jp/blastkoala/



UCSC
Fonction : Visualisation du génome
Site internet:http://genome.ucsc.edu/index.html



SII
Fonction : Dessiner un schéma de la structure de la séquence
Site internet:http://ibs.biocuckoo.org/online.php



RAP
Fonction : Analyse en ligne de l’ARN-seq
Site internet:https://bioinformatics.cineca.it/rap/



AUGUSTUS
Fonction : Entron exon génétique, UTR, annotation
Site internet:http://bioinf.uni-greifswald.de/webaugustus/prediction/create



GSDS
Fonction : Intron des exons géniques, UTR, domaine et autres caractéristiques régionales affichées
Site internet:http://gsds.cbi.pku.edu.cn/





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