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[Outros] Um resumo de 20 ferramentas clássicas de biologia online

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Publicado em 06/12/2018 08:28:12 | | |
Escaneamento do Promotor
Função: Previsão do promotor
Site:https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/



Localizador ORF
Função: Previsão ORF
Site:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/



NCBI-BLAST
Função: Alinhamento de sequências
Site:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi



MÚSCULO
Função: Alinhamento multi-sequência com velocidade de execução relativamente alta
Site:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#



Clustal Omega
Função: Alinhamento multi-sequência de DNA, RNA e proteína
Site:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/



ClustalW2
Função: Alinhamento multi-sequência amplamente utilizado
Site:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/



T-Coffee
Função: Alta precisão, alinhamento lento em múltiplas sequências
Site:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/



SimiTriX-SimiTetra
Função: Exibição de similaridade de alinhamento multi-sequência
Site:http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php



Venn Picture
Função: Desenhar diagramas de Venn
Site:http://www.biovenn.nl/index.php



Venn Picture
Função: Desenhar diagramas de Venn
Site:http://bioinformatics.psb.ugent.... calculate_venn.htpl



Venn Picture
Função: Desenhar diagramas de Venn
Site:http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html



WEGO
Função: Desenhar gráfico de resultados de anotação GO
Site:http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl



CIRCOS
Função: Desenhar diagramas circulares
Site:http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/



CIRCexplorer
Função: Realizar análise de circRNA
Site:http://circexplorer2.readthedocs.io/en/latest/



iPath
Função: Realizar análise online de mapas visuais de caminhos
Site:http://pathways.embl.de/



KEGG
Função: Anotar as vias metabólicas dos genes
Site:http://www.kegg.jp/blastkoala/



UCSC
Função: Visualização do genoma
Site:http://genome.ucsc.edu/index.html



SII
Função: Desenhar um diagrama esquemático da estrutura da sequência
Site:http://ibs.biocuckoo.org/online.php



RAP
Função: Análise online do RNA-seq
Site:https://bioinformatics.cineca.it/rap/



AUGUSTO
Função: Intrron de exon gênico, UTR, anotação
Site:http://bioinf.uni-greifswald.de/webaugustus/prediction/create



GSDS
Função: Intrônio gênico, UTR, domínio e outras características regionais exibido
Site:http://gsds.cbi.pku.edu.cn/





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