Podsumowanie 20 klasycznych narzędzi biologicznych dostępnych online

lato · Opublikowano 06.12.2018 08:28:12

Skan promotora
Funkcja: Predykcja promotora
Strona internetowa:https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/

ORF Finder
Funkcja: Predykcja ORF
Strona internetowa:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/

NCBI-BLAST
Funkcja: Wyrównanie sekwencji
Strona internetowa:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

MIĘŚNIE
Funkcja: Wielosekwencyjne wyrównanie z relatywną prędkością pracy
Strona internetowa:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#

Clustal Omega
Funkcja: Wielosekwencyjne wyrównanie DNA, RNA i białka
Strona internetowa:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/

ClustalW2
Funkcja: Szeroko stosowane wielosekwencyjne wyrównanie
Strona internetowa:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/

T-Coffee
Funkcja: Wysoka dokładność, powolne wyrównanie wielosekwencyjne
Strona internetowa:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/

SimiTriX-SimiTetra
Funkcja: Wielosekwencyjne wyświetlanie podobieństwa
Strona internetowa:http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php

Obraz Venna
Funkcja: Narysuj diagramy Venna
Strona internetowa:http://www.biovenn.nl/index.php

Obraz Venna
Funkcja: Narysuj diagramy Venna
Strona internetowa:http://bioinformatics.psb.ugent.... calculate_venn.htpl

Obraz Venna
Funkcja: Narysuj diagramy Venna
Strona internetowa:http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

WEGO
Funkcja: Rysuj wykres wyników adnotacji GO
Strona internetowa:http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl

CIRCOS
Funkcja: Rysuj diagramy kołowe
Strona internetowa:http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/

CIRCexplorer
Funkcja: Wykonaj analizę cyrcRNA
Strona internetowa:http://circexplorer2.readthedocs.io/en/latest/

iPath
Funkcja: Przeprowadzenie analizy online map ścieżek wzrokowych
Strona internetowa:http://pathways.embl.de/

KEGG
Funkcja: Anotacja szlaków metabolicznych genów
Strona internetowa:http://www.kegg.jp/blastkoala/

UCSC
Funkcja: Wizualizacja genomu
Strona internetowa:http://genome.ucsc.edu/index.html

IBS
Funkcja: Narysuj schematyczny diagram struktury sekwencji
Strona internetowa:http://ibs.biocuckoo.org/online.php

RAP
Funkcja: Analiza online RNA-seq
Strona internetowa:https://bioinformatics.cineca.it/rap/

AUGUSTUS
Funkcja: Intron genu eksonowego, UTR, adnotacja
Strona internetowa:http://bioinf.uni-greifswald.de/webaugustus/prediction/create

GSDS
Funkcja: Intron genu eksonu, UTR, wyświetlenie charakterystyki domeny i innych regionalnych
Strona internetowa:http://gsds.cbi.pku.edu.cn/

[Inne] Podsumowanie 20 klasycznych narzędzi biologicznych dostępnych online

Powiązane wpisy

Oglądane sekcje