古典的な生物学オンラインツール20の要約

夏 · 掲載地 2018/12/06 8:28:12

プロモータースキャン
機能:プロモーター予測
ウェブサイト：https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/

ORFファインダー
機能:ORF予測
ウェブサイト：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/

NCBI-ブラスト
機能:配列アライメント
ウェブサイト：https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

筋肉
機能:比較的高速な多順序アライメント
ウェブサイト：http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#

クルスタル・オメガ
機能:DNA、RNA、タンパク質の多配列アラインメント
ウェブサイト：http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/

ClustalW2
機能:広く使われている多重配列アライメント
ウェブサイト：http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/

T-コーヒー
機能:高精度で遅い多シーケンスアライメント
ウェブサイト：http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/

シミトリックス-シミテトラ
機能:多シーケンスアラインメント類似表示
ウェブサイト：http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php

ヴェン・ピクチャー
機能:ベン図を描く
ウェブサイト：http://www.biovenn.nl/index.php

ヴェン・ピクチャー
機能:ベン図を描く
ウェブサイト：http://bioinformatics.psb.ugent.... calculate_venn.htpl

ヴェン・ピクチャー
機能:ベン図を描く
ウェブサイト：http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

WEGO
機能:GO注釈結果グラフを描く
ウェブサイト：http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl

サーコス
機能:円形図を描く
ウェブサイト：http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/

CIRCexplorer
機能:circRNA解析を行う
ウェブサイト：http://circexplorer2.readthedocs.io/en/latest/

iPath
機能:視覚経路マップのオンライン解析を行う
ウェブサイト：http://pathways.embl.de/

ケッグ
機能:遺伝子の代謝経路に注釈を付ける
ウェブサイト：http://www.kegg.jp/blastkoala/

UCSC
機能:ゲノム可視化
ウェブサイト：http://genome.ucsc.edu/index.html

過敏性腸症候群(IBS)
機能:配列構造の回路図を描く
ウェブサイト：http://ibs.biocuckoo.org/online.php

ラップ
機能:RNA-seqのオンライン解析
ウェブサイト：https://bioinformatics.cineca.it/rap/

オーガスタス
機能:遺伝子エクソンイントロン、UTR、注釈
ウェブサイト：http://bioinf.uni-greifswald.de/webaugustus/prediction/create

GSDS
機能:遺伝子エクソンのイントロン、UTR、ドメインおよびその他の地域特性の表示
ウェブサイト：http://gsds.cbi.pku.edu.cn/

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