Yhteenveto 20 klassisesta biologian verkkotyökalusta

kesä · Julkaistu 6.12.2018 8.28.12

Promoottoriskannaus
Funktio: Promoottorin ennuste
Verkkosivusto:https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/

ORF Finder
Funktio: ORF-ennuste
Verkkosivusto:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/

NCBI-BLAST
Toiminto: Sekvenssin kohdistus
Verkkosivusto:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

MUSCLE
Toiminto: Monisekvenssisuuntaus suhteellisen nopealla juoksunopeudella
Verkkosivusto:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#

Clustal Omega
Toiminto: DNA:n, RNA:n ja proteiinin monisekvenssien kohdistus
Verkkosivusto:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/

ClustalW2
Toiminto: Laajasti käytetty monisekvenssikohdistus
Verkkosivusto:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/

T-Coffee
Toiminto: Korkea tarkkuus, hidas monisekvenssien kohdistus
Verkkosivusto:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/

SimiTriX-SimiTetra
Toiminto: Monisekvenssisuuntauksen samankaltaisuusnäyttö
Verkkosivusto:http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php

Venn Picture
Toiminto: Piirrä Venn-diagrammit
Verkkosivusto:http://www.biovenn.nl/index.php

Venn Picture
Toiminto: Piirrä Venn-diagrammit
Verkkosivusto:http://bioinformatics.psb.ugent.... calculate_venn.htpl

Venn Picture
Toiminto: Piirrä Venn-diagrammit
Verkkosivusto:http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

WEGO
Funktio: Piirrä GO-annotaatiotulosgraafi
Verkkosivusto:http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl

SIRKOT
Toiminto: Piirrä ympyrädiagrammit
Verkkosivusto:http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/

CIRCexplorer
Toiminto: Suorita circRNA-analyysi
Verkkosivusto:http://circexplorer2.readthedocs.io/en/latest/

iPath
Toiminto: Tehdä visuaalisten reittikarttojen verkkoanalyysi
Verkkosivusto:http://pathways.embl.de/

KEGG
Toiminto: Annotoi geenien aineenvaihduntareitit
Verkkosivusto:http://www.kegg.jp/blastkoala/

UCSC
Funktio: Genomin visualisointi
Verkkosivusto:http://genome.ucsc.edu/index.html

IBS
Funktio: Piirrä kaaviokaavio sekvenssirakenteesta
Verkkosivusto:http://ibs.biocuckoo.org/online.php

RAP
Toiminto: RNA-sekvenssin verkkoanalyysi
Verkkosivusto:https://bioinformatics.cineca.it/rap/

AUGUSTUS
Toiminto: geenieksonin intron, UTR, annotaatio
Verkkosivusto:http://bioinf.uni-greifswald.de/webaugustus/prediction/create

GSDS
Toiminto: Geenieksonin intronin, UTR:n, domeenin ja muiden alueellisten ominaisuuksien näyttäminen
Verkkosivusto:http://gsds.cbi.pku.edu.cn/

[Muut] Yhteenveto 20 klassisesta biologian verkkotyökalusta

Aiheeseen liittyvät julkaisut

Katsotut osuudet