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[Otros] Un resumen de 20 herramientas clásicas de biología en línea

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Publicado en 6/12/2018 8:28:12 | | |
Escaneo del promotor
Función: Predicción del promotor
Sitio web:https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/



Buscador ORF
Función: Predicción ORF
Sitio web:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/



NCBI-BLAST
Función: Alineación de secuencias
Sitio web:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi



MÚSCULO
Función: Alineación multisecuencia con velocidad de funcionamiento relativamente rápida
Sitio web:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#



Clustal Omega
Función: Alineación multisecuencia de ADN, ARN y proteína
Sitio web:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/



ClustalW2
Función: Alineación multisecuencia ampliamente utilizada
Sitio web:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/



T-Café
Función: Alta precisión, alineación lenta con múltiples secuencias
Sitio web:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/



SimiTriX-SimiTetra
Función: Visualización de similitud de alineamiento multisecuencia
Sitio web:http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php



Venn Picture
Función: Dibujar diagramas de Venn
Sitio web:http://www.biovenn.nl/index.php



Venn Picture
Función: Dibujar diagramas de Venn
Sitio web:http://bioinformatics.psb.ugent.... calculate_venn.htpl



Venn Picture
Función: Dibujar diagramas de Venn
Sitio web:http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html



WEGO
Función: Dibujar gráfico de resultados de anotaciones GO
Sitio web:http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl



CIRCOS
Función: Dibujar diagramas de círculos
Sitio web:http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/



CIRCexplorer
Función: Realizar análisis de circARN
Sitio web:http://circexplorer2.readthedocs.io/en/latest/



iPath
Función: Realizar análisis en línea de mapas visuales de rutas
Sitio web:http://pathways.embl.de/



KEGG
Función: Anotar las vías metabólicas de los genes
Sitio web:http://www.kegg.jp/blastkoala/



UCSC
Función: Visualización del genoma
Sitio web:http://genome.ucsc.edu/index.html



SII
Función: Dibujar un diagrama esquemático de la estructura de la secuencia
Sitio web:http://ibs.biocuckoo.org/online.php



RAP
Función: Análisis en línea de RNA-seq
Sitio web:https://bioinformatics.cineca.it/rap/



AUGUSTO
Función: Intrón de exón genético, UTR, anotación
Sitio web:http://bioinf.uni-greifswald.de/webaugustus/prediction/create



GSDS
Función: Intrón de exón génico, UTR, dominio y otras características regionales que se muestran
Sitio web:http://gsds.cbi.pku.edu.cn/





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