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[Sonstige] Eine Zusammenfassung von 20 klassischen Online-Tools zur Biologie

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Veröffentlicht am 06.12.2018 08:28:12 | | |
Promoter-Scan
Funktion: Promotorvorhersage
Website:https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/



ORF Finder
Funktion: ORF-Vorhersage
Website:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/



NCBI-BLAST
Funktion: Sequenzausrichtung
Website:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi



MUSKEL
Funktion: Mehrfach-Sequenz-Ausrichtung mit relativ hoher Laufzeit
Website:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#



Clustal Omega
Funktion: Multi-Sequenz-Ausrichtung von DNA, RNA und Protein
Website:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/



ClustalW2
Funktion: Weit verbreitete Multi-Sequenz-Ausrichtung
Website:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/



T-Coffee
Funktion: Hohe Genauigkeit, langsame Multi-Sequenz-Ausrichtung
Website:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/



SimiTriX-SimiTetra
Funktion: Mehrfach-Sequenz-Ähnlichkeitsanzeige
Website:http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php



Venn-Bild
Funktion: Zeichnen Sie Venn-Diagramme
Website:http://www.biovenn.nl/index.php



Venn-Bild
Funktion: Zeichnen Sie Venn-Diagramme
Website:http://bioinformatics.psb.ugent.... calculate_venn.HTPL



Venn-Bild
Funktion: Zeichnen Sie Venn-Diagramme
Website:http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html



WEGO
Funktion: Draw GO Annotation Ergebnisgraph
Website:http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl



CIRCOS
Funktion: Kreisdiagramme zeichnen
Website:http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/



CIRCexplorer
Funktion: Durchführung circRNA-Analyse
Website:http://circexplorer2.readthedocs.io/en/latest/



iPath
Funktion: Online-Analyse visueller Pfadkarten durchführen
Website:http://pathways.embl.de/



KEGG
Funktion: Annotieren der Stoffwechselwege von Genen
Website:http://www.kegg.jp/blastkoala/



UCSC
Funktion: Genomvisualisierung
Website:http://genome.ucsc.edu/index.html



IBS
Funktion: Zeichnen Sie ein schematisches Diagramm der Sequenzstruktur
Website:http://ibs.biocuckoo.org/online.php



RAP
Funktion: Online-Analyse von RNA-seq
Website:https://bioinformatics.cineca.it/rap/



AUGUSTUS
Funktion: Gen-Exon-Intron, UTR, Annotation
Website:http://bioinf.uni-greifswald.de/webaugustus/prediction/create



GSDS
Funktion: Gen-Exon-Intron, UTR, Domänen- und andere regionale Merkmale zeigen sich
Website:http://gsds.cbi.pku.edu.cn/





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